Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ms4a2P20490 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ms4a2P20490 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms