Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkcaP20444 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms