Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd48P18181 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd48P18181 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms