Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nme1P15532 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nme1P15532 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nme1P15532 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms