Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmnb1P14733 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmnb1P14733 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms