Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd1d1P11609 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd1d1P11609 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms