Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd4P10628 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd4P10628 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.7 ms