Protein–RNA interactions for Protein: P09690

Chrnb1, Acetylcholine receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb1P09690 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrnb1P09690 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms