Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col4a2P08122 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a2P08122 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms