Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col3a1P08121 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col3a1P08121 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms