Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P06336 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06336 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06336 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06336 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P06336 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P06336 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P06336 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P06336 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P06336 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P06336 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms