Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ItgamP05555 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ItgamP05555 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ItgamP05555 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms