Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-AaP01910 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2-AaP01910 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms