Protein–RNA interactions for Protein: P01795

Ig heavy chain V region M167, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01795 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01795 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01795 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01795 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01795 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01795 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms