Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01735 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01735 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01735 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01735 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01735 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01735 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01735 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01735 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms