Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lancl1O89112 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lancl1O89112 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms