Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo1O89026 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Robo1O89026 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Robo1O89026 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms