Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MscO88940 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MscO88940 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MscO88940 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MscO88940 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MscO88940 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MscO88940 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MscO88940 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MscO88940 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms