Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
F11rO88792 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
F11rO88792 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
F11rO88792 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
F11rO88792 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
F11rO88792 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
F11rO88792 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
F11rO88792 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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