Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd46O88174 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd46O88174 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd46O88174 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms