Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CaskO70589 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CaskO70589 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CaskO70589 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CaskO70589 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CaskO70589 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CaskO70589 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms