Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp4O70480 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vamp4O70480 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms