Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cd70O55237 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd70O55237 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd70O55237 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd70O55237 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms