Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms