Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BckdkO55028 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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BckdkO55028 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BckdkO55028 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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