Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SlkO54988 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SlkO54988 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SlkO54988 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SlkO54988 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SlkO54988 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SlkO54988 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
SlkO54988 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms