Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb3O54890 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb3O54890 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms