Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DffaO54786 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DffaO54786 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DffaO54786 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DffaO54786 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DffaO54786 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DffaO54786 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DffaO54786 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DffaO54786 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DffaO54786 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DffaO54786 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DffaO54786 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DffaO54786 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms