Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Gp1baO35930 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gp1baO35930 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms