Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdk5r2O35926 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdk5r2O35926 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms