Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NudcO35685 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NudcO35685 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NudcO35685 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NudcO35685 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NudcO35685 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NudcO35685 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NudcO35685 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms