Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Notch2O35516 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Notch2O35516 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms