Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf5O35445 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rnf5O35445 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rnf5O35445 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rnf5O35445 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rnf5O35445 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf5O35445 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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