Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxd2O35392 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxd2O35392 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms