Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc1O35379 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc1O35379 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms