Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf11aO35305 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfrsf11aO35305 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms