Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm8857L7N291 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8857L7N291 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms