Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6871L7N248 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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