Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm2056J3QQ02 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2056J3QQ02 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms