Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm10428J3QNV7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm10428J3QNV7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm10428J3QNV7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm10428J3QNV7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm10428J3QNV7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm10428J3QNV7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm10428J3QNV7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm10428J3QNV7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm10428J3QNV7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm10428J3QNV7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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