Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21788J3QNH3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21788J3QNH3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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