Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lipo1J3QME6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lipo1J3QME6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms