Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pot1bH7BX60 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pot1bH7BX60 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms