Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfgef1G3X9K3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfgef1G3X9K3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms