Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nccrp1G3X9C2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nccrp1G3X9C2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms