Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chrna9G3X8Z7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Chrna9G3X8Z7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms