Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Farp1F8VPU2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms