Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LctF8VPT3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LctF8VPT3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms