Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ttc37F8VPK0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ttc37F8VPK0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms