Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Crocc2F6XLV1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crocc2F6XLV1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Crocc2F6XLV1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms